豫章书院的最终处理结果如下：

非法拘禁罪判决

创始人吴军豹被判处有期徒刑两年十个月。

其他被告人分别被判处有期徒刑两年多、一年多、几个月不等。

民事诉讼结果

法院驳回了附带民事诉讼原告人罗伟等人的诉讼请求，包括道歉、学费、精神损失费等。

江西省南昌市中级人民法院二审宣判，被告人王某某等11人分别被判处有期徒刑三年至十年不等，并赔偿原告人贝贝等三人共计30万元。

案件进展

2024年12月，南昌警方将此案移送检察机关审查，青山湖区检察院已将此案退回警方补充侦查，南昌市检察院正对案件进行核查，核查结果将向社会公布。

综上所述，豫章书院案的多名被告人已被判刑，但部分原告人的诉求未获法院支持。案件仍在进一步审理中。