千眼菩提打磨后上面有些小孔是 正常现象。以下是对这一现象的解释：

天然孔洞：

千眼菩提子本身就是有孔的，每个菩提子的中间部位都会有一个小孔，这个孔就像星月的月眼一样，是完全正常的。这个孔实际上是菩提子的芽眼，因为菩提子本身就是植物果实，是种子，有一个位置有芽眼。在打磨过程中，这个眼可能会被磨出来。

虫害：

有些小孔可能是由于虫害造成的。虽然肉眼看不见，但平时可以用牙刷刷一刷，以免有灰尘和虫子。

保护作用：

这些小孔在打磨后可能会更明显，但它们实际上是菩提子的天然特征，对菩提子的保护和生长有重要作用。

综上所述，千眼菩提打磨后上面有些小孔是正常现象，不必过于担心。如果需要，可以用牙刷等工具进行清洁和维护。