王菲确实为谢霆锋哭过。

在日本拍戏时

王菲在面对记者提问为什么跟谢霆锋分手时，瞬间情绪上来，无法压抑，眼泪流了下来。这一情景被在场的60多个娱记捕捉到，现场一片混乱。这次流泪表明王菲内心的感情仍然存在，也为后来两人的复合奠定了基础。

谢霆锋车祸顶包案后

2002年初，谢霆锋发生车祸并顶包，王菲在深圳参加颁奖晚会时，听到记者提及谢霆锋车祸，才知道他当晚与张柏芝在一起。王菲在登台演唱时开始流泪，这并非因为分手，而是因为对谢霆锋没有及时通知她而感到伤心。

谢霆锋开始躲避王菲的电话后

王菲敏锐地察觉到谢霆锋开始躲避她的电话，感受到了感情中的变数。她再次为谢霆锋心如刀绞地流泪，这次的泪水更多的是深深的失落和无力。

王菲在香港产子后

2021年6月，王菲在香港为谢霆锋产下一子，但至今没有领证。有媒体报道称，王菲在产子后掩面痛哭，而谢霆锋在之后的发布会上哭成了泪人。

综上所述，王菲为谢霆锋哭过至少三次，这些泪水背后是她对谢霆锋深深的情感和复杂的内心世界。