蛋白质组是指 由一个基因组、或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。在转录时，一个基因可以有多种mRNA形式剪接，因此一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物，蛋白质组中蛋白质的数目有时可以超过基因组的数目。

蛋白质的基本组成是碳、氢、氧、氮等元素，此外，多半还含有硫、磷、铁或铜等元素。蛋白质的分子量一般都很大，可从数千到数百万不等。例如，牛胰岛素的分子量为5700，人血红蛋白为64500，蜗牛蓝蛋白为6600000。虽然蛋白质的分子量很大，种类很多，但各种蛋白质的基本组成单位都是氨基酸。

按照不同的分类标准，蛋白质可以分为以下几类：

按照化学结构

球蛋白

谷蛋白

糖蛋白

脂蛋白

按照氨基酸组成

全蛋白质

半完全蛋白质

不完全蛋白质

按照功能

结构蛋白质：如角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白

有生物活性的蛋白质：如酶、激素、免疫球蛋白

食品蛋白质：如牛奶、蛋、豆类、鱼类等

这些分类方法有助于我们更好地理解蛋白质的多样性和功能，从而更好地利用它们在生物体中的作用。