乾隆杀讷亲的主要原因有两点：

将帅不和：

讷亲和张广泗在金川之战中配合失误，相互攻讦，导致清军连战失利，损失惨重。乾隆认为他们不仅不能协同作战，还故意想让对方失败，这种不团结的行为严重影响了战局。

战场失误：

讷亲在金川之战中的表现不佳，先是因为盲目出击导致损兵折将，后来又缩手缩脚，把军事指挥权完全委托给张广泗。这种指挥失误使得清军最终惨败，让乾隆对讷亲的军事能力失去了信心。

综合以上两点，乾隆认为讷亲在战场上的表现严重损害了清朝的利益，且这种失误无法用一般的处罚措施来弥补。因此，他决定赐死讷亲，以示惩戒。