旗县区是指 内蒙古自治区特有的县级行政区。在内蒙古自治区，“旗”的行政地位与县相同，都是县级行政区，由地级市、盟管辖。这种行政区划称谓源于满清八旗制度，是内蒙古自治区特有的一种行政区划形式。

具体来说，旗是内蒙古自治区特有的县级行政区，其行政地位与县相同，但不同于其他省份的县。旗上级是地级行政区，下级是乡级行政区。在清代初年，仿照满洲的八旗制度在蒙古地区设立旗作为基层行政区，沿用至21世纪。

因此，旗县区在内蒙古自治区是指隶属于地级市或盟的县级行政区，具有独特的行政地位和历史背景。