奇门遁甲的创始人是九天玄女。根据古籍《秘藏通玄变化六阴洞微遁甲真经》、《轩辕本纪》、《烟波钓叟歌》等多有记载，大致为当年蚩尤作乱，黄帝频战不克，九天玄女授奇门遁甲术于轩辕黄帝，助黄帝以灭蚩尤。

此外，也有说法认为奇门遁甲是由伏羲所创，但这一说法的权威性较低。另外，姜子牙、黄石公等历史人物也被认为与奇门遁甲有关，但具体贡献和成书过程存在争议。

综合来看，九天玄女被广泛认为是奇门遁甲的创始人，这一说法得到了较多古籍的支持。