昆明网吧 不能通宵营业的原因主要与《互联网上网服务营业场所管理条例》有关。根据该条例，互联网上网服务营业场所的营业时间被限制在每日8时至24时之间。尽管有例外情况，例如带有“网咖”字样的网吧可能提供通宵服务，但这通常需要支付额外费用，并且营业时间可能因地区而异。

此外，虽然电子实名登记系统旨在防止网民长时间沉迷网络，但它并不直接限制网吧的营业时间。该系统会在网民连续上网超过一定时间后自动下线，但并未规定网吧必须在此时间后停止营业。

综上所述，昆明网吧不能通宵营业的主要原因是受到《互联网上网服务营业场所管理条例》的限制，该条例明确规定了网吧的营业时间不得超过每日8时至24时。