卡卡西杀掉琳的原因主要是 为了保护村子和小队成员的安全。在《火影忍者》中，琳是木叶村的亲兵之一，对村子的秘密和机密了解较多。如果她被敌方控制，可能会暴露出村庄的重要机密，严重威胁到木叶村的安全。同时，卡卡西也考虑到，如果琳成为了敌方，他们的小队成员也可能会遭到攻击。因此，为了确保小队成员的安全，卡卡西决定采取行动，杀死琳。

此外，还有其他一些细节可以支持这一观点：

琳的主动牺牲：

在神无毗桥之战中，琳为了不让雾忍偷袭木叶的计划得逞，主动冲向了卡卡西的雷切，选择了死亡。

带土的嘱托：

带土在临终前拜托琳把自己刚刚觉醒的写轮眼移植给卡卡西，并嘱托卡卡西照顾好琳。

卡卡的内心挣扎：

卡卡西深知，如果他不果断出手，琳可能会被敌人操控，成为他们的工具，甚至可能导致更多无辜生命的丧失。为了保护村子、保护更多的人，卡卡西的内心斗争异常激烈，最终选择了这个看似残酷但却是为了更大目标的决定。

综上所述，卡卡西杀掉琳是出于保护村子和小队成员安全的考虑，这是一个艰难但必要的决定。