部长助理和副部长的区别主要体现在以下几个方面：

工作职责

部长助理：主要协助部长做好部门的内部管理，并完成部长安排的临时性工作。他们可能还会兼任司长，作为部领导和司长双重身份使用。

副部长：负责组织工作的建章立制，督促落实各项制度的贯彻执行情况。具体职责包括做好基层党总支、党支部的换届选举工作，深入基层调查研究，指导基层党组织有效开展工作，负责对各基层党总支发展党员工作的指导、督促和检查等。

级别

部长助理：虽然也属于中管干部，但一般都是正司局级，只有个别人高配副部级。在某些情况下，部长助理可以享受副部级的部分待遇，如办公用房、公务用车、秘书配备等。

副部长：是副部级干部，少数还可能高配正部。副部长在部领导中地位较高，权限较部长助理更大，机关中的排名在部长助理之前。

职务分工

部长助理：分工一般不会太多，整体上比副部长少。他们直接对部长负责，协助部长负责具体的业务工作。

副部长：直接分管某一方面事务，管理范围较部长助理更大，有时需要管理多个分局或部门。

晋升前景

部长助理：往往成为司长与副部长之间的跳板，担任部长助理的领导干部几年之内通常都会顺利晋升到副部级实职岗位上。

综上所述，部长助理和副部长在工作职责、级别、职务分工和晋升前景等方面存在明显差异。部长助理主要协助部长进行内部管理，级别一般为正司局级，而副部长则是副部级干部，负责更广泛的组织和管理工作，并有较大的管理权限。