在《武装炼金》的结局中，男主角最终 与树一起从月球返回地球，并过上了幸福的生活。具体来说，蝶野成功研制出第二块白色核铁，消除了树的维克多化，使得人造人得以移居月球。男主角回到地球后，与树团聚，并且世界恢复了和平。最后，一个带蝴蝶面具的人给了男主角一个白色的晶板，随后两人一起打败了敌人，结束了故事。

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