《新还珠格格》的大结局中，晴儿是否怀孕并没有给出明确的答案。以下是一些相关的信息：

晴儿和萧剑回到云南大理，并且萧剑和晴儿结婚了，他们养了一个孩子叫小太阳。

永琪为了给自己的额娘留下一个希望，和欣荣生下了一个小阿哥，名叫绵亿。

结局没有提到晴儿怀孕，也没有明确说明她是否真的怀孕了。

因此，虽然有些信息暗示晴儿可能怀孕了，但并没有确凿的证据或明确的情节表明她在结局时确实怀孕了。