可研报告和项目申请报告的收费标准计算方法主要依据《建设项目前期工作咨询收费暂行规定》以及行业特点和工程复杂程度。以下是具体的计算方法：

按建设项目估算投资额分档收费标准

估算投资额在3000万元以下的项目，收费标准为6-14万元。

估算投资额在1亿元至5亿元之间的项目，收费标准为14-37万元。

估算投资额在5亿元至10亿元之间的项目，收费标准为37-55万元。

估算投资额在10亿元至50亿元之间的项目，收费标准为55-100万元。

估算投资额在50亿元以上的项目，收费标准为100-125万元。

按建设项目估算投资额的具体计算方法

建设项目的具体收费标准根据估算投资额在相对应的区间内用插入法计算。

行业调整系数

根据行业特点和各行业内部不同类别工程的复杂程度，计算咨询费用时可分别乘以行业调整系数。例如：

石化、化工、钢铁行业的调整系数为1.3。

石油、天然气、水利、水电、交通（水运）、化纤行业的调整系数为1.2。

有色、黄金、纺织、轻工、邮电、广播、电视、医药、煤炭、火电（含核电）、机械（含船舶、航空、航天、兵器）行业的调整系数为1.0。

林业、商业、粮食、建筑行业的调整系数为0.8。

建材、交通（公路）、铁道、市政公用工程行业的调整系数为0.7。

工程复杂程度调整系数

工程复杂程度调整系数在0.8-1.2之间，具体数值根据项目的实际情况确定。

咨询人员工日费用标准

咨询人员的工日费用标准也影响最终收费，具体费用根据咨询人员的职级和工日费用标准计算。

综上所述，可研报告和项目申请报告的收费标准是根据项目的估算投资额、行业特点、工程复杂程度以及咨询人员的职级等多个因素综合计算的。具体收费金额需根据项目的实际情况，在上述分档收费标准的基础上进行调整。