那曲地区位于 西藏自治区北部，其地形复杂多样，包括唐古拉山脉、念青唐古拉山脉和冈底斯山脉等。整个地区的平均海拔在 4500米以上。具体到各个部分，中西部地形辽阔平坦，多丘陵盆地，湖泊星罗棋布，河流纵横其间，海拔在3500-4500米之间。西北部海拔较高，由于地处念青唐古拉山脉的分支山脉或余脉，山峰较多，地势险峻，高差显著，海拔高度均在5500米以上，最高的桑顶康桑山，海拔约6500米。东部属高原山地，海拔在3800-4500米之间，平均海拔约4100米。南部属藏北高原与藏东高山峡谷交汇地带，部分地区海拔在5000米以上，属高原丘陵；部分地区高山突兀，山势陡峻，高山与高山间形成狭长的深谷；在邻近林芝地区的地方，海拔高度急剧下降，海拔仅有3000米左右。

那曲地区属亚寒带气候区，高寒缺氧，气候干燥，多大风天气，年平均气温为-0.9℃至-3.3℃，年相对湿度为48-51%，年降水量380毫米，年日照时数为2852.6-2881.7小时，全年无绝对无霜期。