大学校运会通常是以 学院为单位进行的。学院是学校的二级学院，如果学校有系的话，也可以以系为单位参加校运会。具体参赛单位取决于学校的组织结构。如果是学院级别的校运会，那么各个学院会选出代表本学院的参赛选手，然后这些选手将代表各自的学院与其他学院的参赛选手进行比赛。如果学校有系，且系直接属于学校而不是某个学院，那么系也可以作为独立的单位参加校运会。

需要注意的是，这里所说的校运会通常指的是学校内部的体育比赛活动，而不是指国际性的大学生运动会（Universiade），后者是由国际大学体育联合会（FISU）主办的全球性大型综合性运动会，参赛单位是以国家为单位的。